枯草芽孢桿菌可作為微生物調(diào)節(jié)劑，起到改善水質(zhì)，抑制有害微生物，營(yíng)造優(yōu)良的水生生態(tài)環(huán)境。由于養(yǎng)殖水體中動(dòng)物長(zhǎng)期高密度養(yǎng)殖，大量的餌料殘?jiān)?dòng)物殘骸、糞便沉積物等污染物堆積，極易導(dǎo)致水質(zhì)惡化，危害養(yǎng)殖動(dòng)物的健康，甚至減產(chǎn)，造成損失。對(duì)水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)的可持續(xù)發(fā)展危害巨大。而枯草芽孢桿菌可通過(guò)養(yǎng)分競(jìng)爭(zhēng)或空間位點(diǎn)競(jìng)爭(zhēng)定殖在水體中，形成優(yōu)勢(shì)菌群，抑制水體中有害病原菌（如弧菌、大腸桿菌）等有害微生物的生長(zhǎng)繁殖，從而改變水體和底泥中的微生物數(shù)量和結(jié)構(gòu)，可以有效預(yù)防水生動(dòng)物因水質(zhì)惡化引起的疾病。同時(shí)，枯草芽孢桿菌作為一種能分泌胞外酶的菌株，其分泌的多種酶類(lèi)能有效分解水中的有機(jī)物，改善水質(zhì)。例如，枯草芽孢桿菌產(chǎn)生的幾丁質(zhì)酶、蛋白酶、脂肪酶等活性物質(zhì)，可以分解水中的有機(jī)物，降解動(dòng)物飼料中的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)，不僅使動(dòng)物能夠充分吸收和利用飼料中的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)，還能大大改善水質(zhì)；枯草芽孢桿菌還可以調(diào)節(jié)養(yǎng)殖水的pH值。